Experimental Run Time results

Datafile
Superlink
Pedfile
Num people
Num typed
Num loci
Genehunter v2.1
Runtime (sec)
Superlink v1.6
Runtime (sec)
Superlink v1.7
Runtime (sec)
Allegro v2.0
Runtime (sec)
Ln-Likelihood/
LodScore
datafile_Families_Type2_1000.dat pedfile_Families_Type2_1000_11.dat 13 13 1000 X 16.39 3.56 1.64 20850.768998/-23909.19
datafile_Families_Type2_1000.dat pedfile_Families_Type2_1000_12.dat 12 12 1000 X 33.72 7.2 3.42 3182.852207/-20590.26
datafile_Families_Type2_1000.dat pedfile_Families_Type2_1000_13.dat 14 14 1000 X 73.53 10.42 8.12 17334.436420/-24611.06
datafile_Families_Type2_1000.dat pedfile_Families_Type2_1000_14.dat 13 13 1000 X 192.82 30.58 18.69 4391.272324/-21736.79
datafile_Families_Type2_1000.dat pedfile_Families_Type2_1000_15.dat 15 15 1000 X 391.03 76.82 66.02 21866.601513/-25498.58
datafile_Families_Type2_1100.dat pedfile_Families_Type2_1100_12.dat 12 12 1100 X 37.54 5.51 4.65 1714.022048/-22573.12
datafile_Families_Type2_1100.dat pedfile_Families_Type2_1100_13.dat 14 14 1100 X 112.06 11.42 8.76 1008.895991/-26921.35
datafile_Families_Type2_1100.dat pedfile_Families_Type2_1100_14.dat 13 13 1100 X 173.19 33.78 14.07 3200.921716/-23335.69
datafile_Families_Type2_1100.dat pedfile_Families_Type2_1100_15.dat 15 15 1100 X 358.48 50.99 29.04 5558.557728/-28051.02
datafile_Families_Type2_1100.dat pedfile_Families_Type2_1100_16.dat 14 14 1100 X 781.39 178.21 81.69 5015.908833/-24053.77
datafile_Families_Type2_1200.dat pedfile_Families_Type2_1200_11.dat 13 13 1200 X 28.04 4.27 1.9 10104.235493/-28814.22
datafile_Families_Type2_1200.dat pedfile_Families_Type2_1200_12.dat 12 12 1200 X 57.34 6.04 3.85 14707.010977/-24462.80
datafile_Families_Type2_1200.dat pedfile_Families_Type2_1200_13.dat 14 14 1200 X 87.39 17.52 9.49 26755.850993/-29917.75
datafile_Families_Type2_1200.dat pedfile_Families_Type2_1200_14.dat 13 13 1200 X 197.3 37.57 18.04 22734.342345/-25328.02
datafile_Families_Type2_1200.dat pedfile_Families_Type2_1200_15.dat 15 15 1200 X 390.77 55.45 43.19 6510.810341/-31324.23
datafile_Families_Type2_1200.dat pedfile_Families_Type2_1200_16.dat 14 14 1200 X 820.77 138.54 83.67 17366.479815/-26420.78
datafile_Families_Type2_1300.dat pedfile_Families_Type2_1300_11.dat 13 13 1300 X 21.1 3.24 2.66 9507.734774/-31152.73
datafile_Families_Type2_1300.dat pedfile_Families_Type2_1300_12.dat 12 12 1300 X 43.95 6.49 5.91 15283.294278/-26651.87
datafile_Families_Type2_1300.dat pedfile_Families_Type2_1300_14.dat 13 13 1300 X 275.83 28.84 27.53 12719.202045/-28125.24
datafile_Families_Type2_1300.dat pedfile_Families_Type2_1300_15.dat 15 15 1300 X 558.96 60.03 45.06 6091.305804/-33811.88
datafile_Families_Type2_1300.dat pedfile_Families_Type2_1300_16.dat 14 14 1300 X 893.39 168.79 117.49 28185.153092/-28739.53
datafile_Families_Type2_1300.dat pedfile_Families_Type2_1300_18.dat 15 15 1300 X X 687.65 420.65 30049.910623/-30037.98
datafile_Families_Type2_1400.dat pedfile_Families_Type2_1400_10.dat 14 14 1400 X 15.93 2.56 1.56 25795.432123/-38944.76
datafile_Families_Type2_1400.dat pedfile_Families_Type2_1400_11.dat 13 13 1400 X 23.39 4.91 2.13 29200.231742/-33955.26
datafile_Families_Type2_1400.dat pedfile_Families_Type2_1400_12.dat 15 15 1400 X 52.32 10.01 4.06 8241.932670/-39754.68
datafile_Families_Type2_1400.dat pedfile_Families_Type2_1400_14.dat 13 13 1400 X 248.11 34.25 24.75 11978.817553/-29799.72
datafile_Families_Type2_1400.dat pedfile_Families_Type2_1400_15.dat 15 15 1400 X 479.05 88.63 35.78 202.784831/-35973.01
datafile_Families_Type2_1400.dat pedfile_Families_Type2_1400_16.dat 14 14 1400 X 947.84 209.92 81.38 1603.952894/-30925.48